Однако в ходе Кавказской войны русская армия десятилетиями занималась в основном Восточной Черкессией и Чечней: в верховьях Терека проходила стратегически важная Военно-Грузинская дорога, на которую постоянно нападали горцы. Поэтому царская армия во время Кавказской войны ограничивалась лишь морской блокадой побережья и поддержанием линий укреплений вдоль берега Кубани. Война с племенами Закубанья перешла в активную фазу лишь в самом конце войны, в 1860-е годы, когда царская армия начала наступление в Закубанье. После жестоких боев сопротивление адыгов было сломлено. Царские военные власти выставили местным племенам ультиматум: либо принять русское подданство и выселиться на "плоскость" (то есть на степную часть нынешней Адыгеи), либо принять турецкое подданство и выселиться в Турцию. Примерно десятая часть переселилась на берег Кубани, а большая и наиболее непримиримая часть предпочла выселиться в Турцию (по разным оценкам, от 500 тыс до 4 миллионов человек). Массовая депортация, известная в истории как [https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%A7%D0%B5%D1%80%D0%BA%D0%B5%D1%81%D1%81%D0%BA%D0%BE%D0%B5_%D0%BC%D1%83%D1%85%D0%B0%D0%B4%D0%B6%D0%B8%D1%80%D1%81%D1%82%D0%B2%D0%BE Черкесское Мухаджирство] сопровождалась многочисленными жертвами в дороге и по прибытии в Турцию (по некоторым оценкам, погибло до половины адыгских переселенцев, в основном от болезней). До сих пор среди адыгов существует общественное движение, которое требует от правительства РФ признать тогдашнее выселение геноцидом адыгского народа, и обеспечить репатриацию адыгов из Турции, Сирии и прочих стран бывшей Османской империи.